甲状腺囊肿是一种地方性流行疾病，发病机制目前尚不明确，可能与碘代谢、环境、精神等因素息息相关，由于缺碘引起甲状腺增生肿大，进一步出现甲状腺囊肿。此病情好发于中青年女性，缺碘和长期情绪低落者也易发作。
一、主要病因
1、碘代谢：身体吸取的碘减少，导致血中甲状腺素浓度降低。通过神经-体液调节，使垂体前叶分泌促甲状腺素增多，促使甲状腺肿大，从而诱发甲状腺囊肿。
2、环境因素：该病的发生与生活环境也有关系，比如饮用水或者食物被废水、废物污染。污染物质由此进入人体，也可以导致一些疾病的发生，从而引起甲状腺囊肿。
3、精神因素：由于精神过度紧张，或者受到强烈的刺激而情绪激动，可能会导致内分泌调节紊乱，影响激素水平，从而引起甲状腺囊肿。
二、诱发因素
1、碘元素缺乏，导致甲状腺素相对匮乏，而引发甲状腺囊肿。
2、伴有甲状腺疾病，易诱发甲状腺囊肿。