结石引起的疼痛可以进行止痛的对症治疗，比如肾结石掉到输尿管中，会引起输尿管强烈的痉挛，从而引起剧烈的肾绞痛。需要去医院急诊进行止痛治疗，常用654-2、杜冷丁、吗啡进行止疼，疼痛缓解以后再进行检查和治疗。
如果结石掉到输尿管的末端，可能会刺激膀胱，产生尿频、尿急、尿痛的症状，可以用一些松弛膀胱肌肉的药物。比如α受体阻滞剂，改善膀胱的痉挛症状，帮助缓解疼痛。如果是尿道结石，也会引起剧烈疼痛，因为结石堵塞尿道而导致排尿困难，或者划伤尿道黏膜也会引起疼痛。小的结石可以通过使劲排尿，把结石排出来，大的结石实在排不出来可以通过尿道镜把结石推入膀胱。用异物钳把结石夹碎取出，或者通过激光打碎结石再排出来。