生化妊娠一般不会造成输卵管阻塞，但是输卵管阻塞常常有多种原因造成，最多见的原因是慢性炎症，一些子宫内膜异位症等情况也会造成输卵管不通。
生化妊娠与输卵管阻塞没有直接关系，但如果机体已经存在了慢性炎症，或者其他可以导致输卵管阻塞的疾病，就可能会出现输卵管不通的现象。首先，生化妊娠这一概念是目前近几年来才采用，一般没有发现宫内有胎囊，同时HCG出现增高，阴道出血以后HCG自然降到正常，这种情况称之为生化妊娠。