鼠咬热的病变无特异性，病原体可分为小螺菌和念珠状链杆菌。发病机制尚未充分阐明，可能与体液、细胞免疫参与有关。
1、小螺菌鼠咬热：小螺菌经家鼠或其他啮齿类动物所咬的伤口侵入淋巴系统，在淋巴结内繁殖，引起局限淋巴结炎，以后病原菌进入体循环，形成菌血症则引起一系列的临床表现。小螺菌型鼠咬热可周期性复燃，其原发灶中的病原菌周期性入血，导致临床症状呈周期性反复发作。
2、念珠状链杆菌鼠咬热：念珠状链杆菌型鼠咬热基本上同小螺菌型鼠咬热，念珠状链杆菌病菌大多一次释放入血，故临床上常无周期性发作。念珠状链杆菌所致病理变化主要是各脏器充血、水肿和单核细胞浸润，念珠状链杆菌可从局部病变组织和血中检出。