原发性心脏恶性肿瘤的发病率，临床认识不足，其病因与发病机制目前也尚未得到确切的研究结果，但有学者提出其发病可能与基因突变、遗传等因素存在紧密的联系。临床发现中老年人群、阳性家族史者、罹患心血管病变的人易患此病，可由放射线、石棉、不良的饮食习惯等因素所诱发。
一、主要病因
1、基因突变：目前有研究表明，部分原发性心脏肉瘤患者携带突变基因，主要有TP53、BRCA2和K-ras等基因的突变，这提示多基因变异与肉瘤风险相关。基因突变的产生可能与患者曾接触射线或不良的生活习惯所致。
2、遗传因素：部分原发性心脏恶性肿瘤患者有一定的家族遗传性，家族中若曾有患病的病例，其再发恶性肿瘤的风险明显提高，多发生在原发性心脏淋巴瘤、浆细胞瘤等心脏血液淋巴系统肿瘤中。
二、诱发因素
1、放射线：原发性心脏恶性肿瘤如肉瘤、淋巴瘤、间皮瘤等的发生受临床治疗性放射线影响。
2、基础心脏病变：心脏既往有慢性炎症、陈旧性瘢痕或淀粉样变等变质变性时，可诱发恶性肿瘤的形成。