判定灰指甲首先是从形态上，正常指甲是呈淡红色或者是淡白色、光滑、有光泽，比较规范的形状，如果指甲遭到破坏，从颜色上可以是黄色、白色，凸凹不平，甲下有碎屑是被破坏的迹象，所以首先从临床上可以看到这些改变。
还有是做实验室检查，甲下边的碎屑可以在显微镜下看到真菌的菌丝成分，就是病原体，也可以做一些培养，进一步确认是哪种菌感染。所以，首先从外观、形态上发现有变化。