外伤性食管穿孔治疗原则为消灭感染、进行正确的胸腔闭式引流术、用广谱抗生素控制疾病提高患者抵抗力，一般用于手术治疗该疾病，治疗期间不能进食，经过2-4个月可治愈。
一、一般治疗
一经发现即应禁食禁水、留置胃管行胃肠减压，防止消化液进一步流入纵隔、胸腔等。如果是颈段食管损伤，症状较轻者，有可能通过禁食禁水、胃肠减压、肠外营养等治愈，但是需要密切观察病情，一旦加重仍需手术清创治疗。胸段以下食管穿孔，基本均需手术治疗，大多数仅凭手术缝合食管无法治愈，术后再次裂开的可能性极大。现在有很多经胃镜下夹闭食管破口，然后胸腔镜手术放置冲洗、引流管治疗，也取得很好的疗效。
二、药物治疗
1、头孢地尼分散片：用于防止感染，但对青霉素或头孢菌素有过敏史者慎用。
2、肠内营养粉剂：用于不能口服或肠内进食的情况。
三、手术治疗
1、初期缝合修补：主要适用于穿孔后24h以内者，感染和食管壁炎性水肿的严重程度则是重要的决定因素。缝合修补时可将创缘稍加修剪，用细丝线间断缝合食管黏膜层和肌层。
2、食管置管术：对于食管缺损较大，或者穿孔时间较长的患者，不应缝合食管破裂口，因几乎一定会再次裂开。应放置冲洗、引流管，并应放置多根口径较粗的引流管。食管修补或者放置纵隔、胸腔引流管等现在一般均可在胸腔镜下微创进行。
3、颈段食管外置(或造口)并胃造口术：晚期食管穿孔，胸腔感染严重或病人情况差不能耐受开胸手术者，可将颈段食管外置(或造口)，胸腔闭式引流，这种手术方法的目的是阻止从口腔带入的感染和胃内容物反流对胸腔的刺激，但大多数病例需要二期手术重建食管。
4、全胸段食管切除术：胸腔引流及应用抗生素等治疗，仍不能控制的严重纵隔感染和食管广泛损伤的病例，可行全胸段食管切除，待患者病情稳定再行二期手术用胃或结肠等重建食管。
5、原有食管疾病并发穿孔的处理：当食管穿孔远端有狭窄、贲门失弛症及裂孔疝等基础疾病，早期若病员情况允许，在穿孔缝合修补后可针对基础疾病进行手术治疗。这种方法可减少唾液和胃内容物污染纵隔，尚有支撑管腔和预防食管瘢痕狭窄的作用。
四、其他治疗
支持治疗：选择肠內营养，加快食管穿孔的愈合速度，防止穿孔处食物泄漏污染伤口。