先兆流产的原因很多，主要包括胚胎因素、母体因素、环境因素。胚胎因素就是胚胎染色体异常，大概占流产原因的50%左右，而且这种胚胎因素流产进行保胎治疗是无效的。母体因素可能是一些严重的全身性疾病，也可能是内分泌的异常，比如黄体功能不足、甲状腺功能低下，还有糖尿病患者血糖没有控制好，可能会导致异常。
还可能是免疫异常导致的流产，比如说抗磷脂综合征，子宫异常，比如畸形子宫、子宫纵隔、单角子宫、宫腔粘连、黏膜下肌瘤，也可能会导致流产。此外，一些过度的紧张、焦虑，还有一些精神的刺激也可能会导致流产的发生。药物、吸烟、酗酒也可能会导致流产的发生，环境因素包括一些化学物质，比如砷、铅、甲醛、苯等化学物质接触的过多也可能会导致流产。