新生儿寒冷损伤综合征的病因包括寒冷和保温不足、严重感染、缺氧等引起的产热能力不足和多器官功能障碍。该病好发于出生后一周内的早产儿、有重症感染的新生儿以及出生时有窒息的新生儿，可由早产、低体重、宫内生长受限、出生窒息、中枢神经系统抑制、先天异常(如腹裂或淋巴水肿)等因素诱发。
一、主要病因
1、寒冷和保温不足：新生儿，尤其是早产儿体温调节中枢不成熟，环境温度低时，产热和散热的调节功能差，使体温降低，具体如下：
（1）体表面积相对较大，皮下脂肪少，皮肤薄，血管丰富，易于失热；
（2）躯体小，总液体含量少，体内储存热量少，对失热的耐受能力差，寒冷时有少量热量丢失，体温便可降低；
（3）新生儿由于缺乏寒战反应，寒冷时主要靠棕色脂肪，早产儿由于其储存少，胎龄越小，储存越少，寒冷时易出现低体温。
2、疾病因素：如严重感染、缺氧、心力衰竭和休克等使能源物质消耗增加、热量摄入不足、产热能力不足，即使在正常散热的条件下，也可出现低体温和皮肤硬肿。严重的颅脑疾病也可抑制尚未成熟的体温调节中枢，其调节功能进一步降低，使散热大于产热，出现低体温，甚至皮肤硬肿。
3、多器官损害：低体温及皮肤硬肿可使局部血液循环淤滞，引起缺氧和代谢性酸中毒，导致皮肤毛细血管壁通透性增加，出现水肿。如低体温持续存在、硬肿面积扩大、缺氧和代谢性酸中毒进一步加重，可引起多器官功能损害。
二、诱发因素
早产、低体重、宫内生长受限、出生窒息、中枢神经系统抑制、先天异常(如腹裂或淋巴水肿)，还有严重感染、缺氧、颅脑损伤、低血糖等因素，可引起新生儿寒冷损伤综合征。