会厌囊肿难以通过吃药来进行消除。会厌囊肿如果没有出现继发炎症感染，造成明显咽痛的症状，就不用特殊的用药治疗。较小的会厌囊肿往往不会引起患者出现明显的不适症状，可能只是在检查中无意中发现。对于体积较大的会厌囊肿，或者造成了患者出现明显的咽喉部堵塞感、异物感等症状，就需要酌情考虑进一步的手术切除治疗。单纯的药物治疗并不能起到理想的效果。