脑炎的主要症状包括全身症状和头部的症状。脑炎通常急性或亚急性起病，任何年龄段均可发病，青少年较常见，病程在儿童时常超过一周，成人可持续两周或更长时间，临床表现有全身症状和头部症状。
全身症状主要表现为发热、畏光、肌肉疼痛、食欲减退、腹泻以及全身乏力等感染的症状，可出现发热，体温一般不超过40℃，部分患者还可表现为头部的症状，如头痛，甚至是剧烈头痛，部位多在眶部或额后，并可伴有恶心、呕吐等症状。