黑热病主要症状是发热，一般为间歇热，体温波动于39～40摄氏度，伴肝脾肿大、中性粒细胞减少、贫血、血小板减少。随病情发展，出现寒战、发热、消瘦、体重和体力下降、鼻出血、紫癜，易继发肺部感染、胃肠道感染、口腔溃疡、坏疽性口炎。在黑热病晚期，皮肤会出现明显的色素沉着斑，这些色素斑在前额、颞部、口周和腹部最为明显。