脑血栓部分病人可有头痛症状，脑血栓患者临床表现取决于梗死灶的大小、部位，通常表现为局灶性神经功能缺损的症状和体征，如偏瘫、偏身感觉障碍、失语、共济失调等，有部分患者可有头痛、呕吐，甚至昏迷等全脑症状。
脑梗塞患者病灶较大或者表现为基底动脉闭塞、大面积脑梗塞时，头痛可较为剧烈，病情严重时可出现意识障碍，甚至有脑疝形成。
脑血栓患者头痛需和脑出血相鉴别，头颅CT是首选的检查方法，头颅CT对于鉴别脑血栓和脑出血具有重要的价值。