肛门瘙痒症患者需要积极查明病因，根据症状严重程度选择合适治疗方法。目前肛门瘙痒症的治疗方法主要有药物、中医、物理、手术治疗，肛门瘙痒保守治疗需长期持续性治疗，手术治疗需1~2周。
一、药物治疗
1、抗组胺药治疗：常用苯海拉明、扑尔敏、息斯敏等，对过敏引起的肛门瘙痒效果好。
2、激素治疗：对女性及老年重症患者可用性激素治疗，对于症状严重者可用糖皮质激素，建议选用弱效糖皮质激素。
3、抗生素治疗：肛门瘙痒合并细菌感染者可根据致病菌选用抗生素。
4、外洗药物治疗：选用低pH和降温、消炎、干燥、止痒的药物，如炉甘石洗剂。
5、钙调神经磷酸酶抑制剂：如他克莫司、吡美莫司等，通过抑制免疫功能可起到止痒作用。
6、表面麻醉剂：如利多卡因乳膏，可用于瘙痒、疼痛严重的患者，具有暂时的缓解作用。
二、手术治疗
1、瘙痒皮肤切除缝合术：麻醉后首先在肛周两侧距肛缘1cm处各做一半月形切口，不宜太宽以免缝合时张力太大，将瘙痒皮肤包括在切口内，然后将两切口内的半月形瘙痒皮肤切除，再用剪刀沿切口游离创口外侧皮肤，减少缝合时张力并在前后和内侧皮下剪断末梢神经，充分止血后冲洗伤口，用4号丝线间断缝合切口。用凡士林纱条覆盖切口，外用塔形纱布压迫，丁字带固定，对侧同法切除和缝合，具有手术创面小、愈合快等优点。
2、肛周皮下神经末梢离断术：适用于顽固性肛门瘙痒无明显皮损经保守治疗无效者，麻醉后分别在肛门前、后位距肛缘1.5cm处各做纵切口，长约1.5cm。用弯止血钳从前方切口进入，紧靠皮下围绕肛周做钝性分离，从后位切口穿出，做一隧道。张开弯止血钳，边退钳边做皮下组织分离，钝性分离皮下神经末梢，分离区域根据瘙痒病变而定。
3、瘙痒皮肤注射术：是目前常用的方法，操作简单、疗效确切。使用药物注射到皮下或皮内，破坏感觉神经，使局部感觉减退、症状消失，可将亚甲蓝通过阻滞神经使患者在1~2周内感觉不到瘙痒，常采用长效糖皮质激素注射到皮下，有持久的抗炎、抗过敏及止痒作用。
三、物理治疗
可用紫外线、红外线照射肛周患处。多种治疗方式未起到疗效时，可进行浅层X线放射治疗。
四、中医治疗
1、内治法：
（1）清热、泻火、通便，可用凉隔散。
（2）疏风、清热、利湿，可选消风散或龙胆泻肝汤。
（3）若杀虫、解毒、止痒，选用乌梅丸。
2、外治法：
（1）皮肤湿润者可用枯矾粉干撒于患处。
（2）皮肤干燥者使用黄连膏外敷。
（3）可选以清热解毒、除湿止痒为主的药物进行温水坐浴。