新生儿大便有泡泡，多半可能是因为新生儿乳糖不耐受。
新生儿由于各脏器发育均不成熟，肠道发育也不成熟，肠道菌群也并没有完全建立，新生儿出生后小肠上皮细胞分泌的乳糖酶不足，因此当进乳后，奶粉或母乳中的乳糖在小肠内不能够被完全分解，会导致乳糖到达结肠内。在结肠细菌的作用下会引起肠道乳糖被分解，并且会产生大量的气体，新生儿就会出现稀便、泡沫样便，并且还会出现放屁增多的情况。