交叉瘫的病变部位是在脑干上，脑干又分为三个部位，即中脑、桥脑和延髓，不同部位表现出来的交叉瘫不一样，比如中脑的病变可以引起病灶同一侧眼球的瘫痪、动眼神经麻痹，而肢体是在对侧。桥脑的病变可以引起病变同一侧面神经的麻痹，而肢体瘫痪也是在对侧。延髓的麻痹也可以出现类似的情况，病变同一侧吞咽困难、迷走神经和舌咽神经麻痹，而瘫痪也是在另一侧，这和负责肢体肌力的传导束有关，传导束在医学上叫锥体束，锥体束到延髓下部的时候才会进行交叉，交叉到对侧，所以肢体的瘫痪是在病灶的对侧，而颅神经的瘫痪在病灶的同一侧。