跖疣的治疗首选冷冻治疗，但可能需要治疗数次，也有的医疗单位用激光的方法。患者也可以局部外用抗病毒的药物，比如含有鬼臼毒素或者干扰素的外用药膏或者药水。对于比较顽固的跖疣还可以选择平阳霉素局部封闭治疗，也可以考虑用光动力的方法来治疗。跖疣是比较顽固的，所以有的时候不仅是一种单一的方法来治疗，也可以几种方法联合治疗。