磷酸肌酸在心肌和骨骼肌的收缩过程中发挥着重要作用，它是心肌和骨骼肌的能量储备。心肌缺血、缺氧可导致心肌细胞的损伤，磷酸肌酸具有心肌细胞保护功能，所以提高心肌细胞内磷酸肌酸水平，常为各种心肌损伤治疗的基本原则，也是心脏代谢保护的基础。临床上多用于心脏手术时，加入心脏停搏液中保护缺血状态下心肌细胞的能量代谢。也用于冠心病和其他原因导致的心肌细胞损伤的保护。