区分普通的龟头炎和梅毒，一个是看临床特点，另一个是看化验检查。梅毒是由梅毒螺旋体感染所引起的一种全身性性传播疾病，在一期梅毒的时候，可以表现为龟头部的硬下疳，主要是局部不痛不痒的硬结和溃疡。二期梅毒可以在龟头部位出现黏膜损害，主要是边界清晰的红斑、糜烂，通常也没有痛和痒的症状。如果是抽血化验梅毒抗体，它是阳性。
普通的龟头炎可以由局部物理刺激所引起，表现为红斑、肿胀、糜烂、渗出，也可以由霉菌感染引起，往往局部红斑表面有白色的奶酪状分泌物，容易刮除，做真菌检查可以查到有念珠菌。如果抽血查梅毒抗体，则为阴性。