肺动脉高压的患者，因为肺循环的障碍，会出现在肺循环内氧合能力的下降，肺泡中的氧气不能有效进入到血液中。同时，血中的二氧化碳也很难交换到肺泡中呼出。这时候血中的二氧化碳浓度较高，就可以导致体内的碳酸氢根浓度增高，引起高碳酸血症，并且同时多伴有比较严重的低氧血症。这是肺动脉高压患者最常见的血气变化，严重者甚至可以出现酸中毒。