脑部的细胞是永久性的细胞，一旦坏掉就永远都不能再生，所以所有造成脑细胞损伤的因素都会导致脑萎缩。其中有不可控的因素，比如年龄，随着年龄的增长，脑部容量就是逐渐下降的，所以就会造成生理脑萎缩，或者叫做老年性的脑萎缩。其中也有非常多可控的因素，比如慢性酒精中毒会导致脑萎缩、局部脑外伤或者脑部开颅手术之后会造成有局部的脑萎缩。
急性的脑血管病之后，不论是脑梗死，还是脑出血，也可以造成局部的脑萎缩。如果有慢性的高血压、糖尿病等损伤血管的危险因素，或者有吸烟，造成小血管的损害，会引起脑室周围白质变性，而导致脑萎缩的发生。同时有一些退行性变，比如阿尔茨海默病，也就是老年性痴呆，或者其他的痴呆类型，都可以导致脑萎缩的发生，所以脑萎缩是非常非常多原因而导致的结局。