目前秋水仙碱是治疗良性阵发性腹膜炎综合征的唯一药物，既可以有效控制该病发作，也能降低肾脏淀粉样变风险，本病需要长期持续性治疗。
一、药物治疗
在治疗上，可应用秋水仙碱以降低其发作次数，发作时可缓慢静脉注射，发作减少后每日维持用药，并作长期预防性治疗(2～3年)，用药注意事项如下:
1、疲劳乏力或压力大期间，可暂时增加秋水仙碱用量,以更好地控制病情。
2、服用秋水仙碱过程中，需要常规监测肝功能。
3、秋水仙碱大剂量使用仍无效果时，可使用IL-1拮抗剂和TNF-a抑制剂等生物制剂，或使用沙利度胺、柳氮磺胺吡啶、非甾体抗炎药等。
二、手术治疗
本病暂无需手术治疗。
三、其他治疗
本病导致肾衰的患者需透析治疗或肾移植。