对于脾囊肿的预防，需要对脾囊肿的好发人群采取针对性的措施。而大部分脾囊肿为良性，当是小囊肿时，需在早期体检发现后，定期进行观察，防范囊肿的恶性发展。
（1）对于免疫力低下的人群可以在日常生活中，进行规律的、适当的体育锻炼，合理膳食补充充足的营养，保持愉悦的心情。
（2）对于高发地区，如北方牧区等，需要进行适当的消毒杀虫的措施，保持水源的清洁。
（3）对于体检发现囊肿的患者，当囊肿较小，对机体不造成影响时，可以不进行手术治疗，但是需要定期前往医院进行复查，观察囊肿的大小等有无变化，及时发现变化，采取治疗措施。