发生甲型流感时，应注意卧床休息，并多饮水，补充足够的液体。饮食上清淡些，但是也要保证营养均衡，摄入足够蛋白质和热量。如果出现高热、周身疼痛，可以应用一些对症治疗，如应用解热镇痛药来降温，同时缓解肌肉酸痛、头痛等症状，应用止咳、祛痰等药物，改善咳嗽、咳痰症状。最主要的是需要针对病原治疗，也就是抗病毒治疗。
需要针对甲型流感病毒，抑制甲型流感病毒的复制，减少病毒的传播，可以应用奥司他韦口服，疗程五天，或者应用阿比多尔口服，疗程也是五天，抗病毒药物越早期应用，效果越好。甲型流感病毒如果机体免疫力较差，可能也会继发细菌感染，根据血常规或肺CT的结果，可以加用抗生素对症治疗。如果出现呼吸困难，或者老年人有基础疾病，病情不见好转，需要及时就医。