自身免疫性脑炎，其发病原因和自身免疫异常有关。一般是由于自身产生了抗中枢神经系统某些抗原的抗体，包括抗神经元表面蛋白抗体、抗神经元细胞内蛋白抗体，通过体液免疫机制，可以导致神经元细胞受损。根据不同的抗神经元抗体和相应的临床综合征，对自身免疫性脑炎进行分类，最常见的是抗NMDN受体脑炎，其它还有抗体相关的边缘性脑炎和自身免疫性脑炎综合征。