尿结石的诊断依赖于临床症状表现和相关的检查，在尿结石发生后，如上尿路结石，可以感觉到腰部和肋脊角的疼痛症状。这种疼痛在肾结石可以表现为隐痛或者钝痛，也可以表现为无症状。在输尿管结石内，可以表现为突发的刀割样疼痛，疼痛剧烈，并向下腹部放射，患者可以出现肉眼血尿或者镜下血尿。
当结石进入输尿管末段时，可以引起膀胱刺激症状，由于结石刺激可引起恶心、呕吐等症状。当出现这类症状进行相关的检查，包括B超、腹平片、静脉尿路造影、CT、磁共振水成像等可以明确诊断。有一部分结石，尤其是肾结石，无明显症状，多在查体时发现。