目前还不清楚阿斯伯格综合征的确切病因和发病机制，研究发现遗传与环境因素、生物化学、过滤性病毒、妊娠和分娩时期出现的问题都与之有关。
一、主要病因
1、遗传因素：若阿斯伯格综合征患者的母亲再次怀孕，第二个子女的阿斯伯格综合征患病危险率5％。一些患者的父母和其他亲属也有社会交往障碍和重复刻板行为。根据双生子同病率研究发现孤独症谱系障碍的遗传度37％～90％。目前已发现常染色体上10个以上与孤独症相关基因，已确认15％患者存在基因变异，但是多数患者可能是多基因的异常所致。
2、环境因素：环境中有害因素及围产期危险因素，例如母亲怀孕或分娩时感染，可能在妊娠早期影响胚胎的发育，增加孤独症患病风险。
3、生物化学：长期接触化学药品、放射性药物、放射类工作等与生化相关事物的人，由于生化物品对脑部有危害，所以也会引起此病。
4、病毒感染：婴儿或围产期病毒感染也会引起阿斯伯格综合征的可能。
二、诱发因素
1、患儿父母或家属中有患此病。
2、围产期或产后感染、药物副作用等。
3、环境因素影响，如长时间接触化学用品或是婴儿期间感染等。