指甲盖凹凸不平，如果是以甲凹点、凹线为表现的凹凸不平，常见于以下几种情况：
一、遗传因素，往往家族成员中有甲凹点的相同表现。
二、深的、顶针状的凹陷，常见于银屑病，这是银屑病的典型的指甲改变。
三、斑秃，有时指甲也会出现排列规则的凹点。
四、不规则的、较大的凹点、凹陷，可见于手部湿疹、肢端皮炎、手癣以及扁平苔藓。
除了甲凹点、凹陷以外，这些皮肤病会有各自的皮肤表现。如果是以甲纵嵴为表现的凹凸不平，常常是甲营养不良的表现，大多是由于维生素或钙吸收不佳引起，也可见于扁平苔藓、慢性湿疹、斑秃、甲减和末梢循环不良者。指甲油中含有色素、溶剂、渗透剂，会损伤甲板，长期使用指甲油，也会导致指甲盖凹凸不平。