骨穿主要是用于血液系统疾病的诊断，比如白血病、再生障碍性贫血等疾病，而脑炎是一种中枢神经系统感染性疾病，脑炎的诊断主要是依赖腰穿脑脊液检查。脑炎根据病原体不同，可以分为病毒性脑炎、结核性脑炎以及化脓性脑炎，各型脑炎常见的共同症状为头痛、恶心呕吐等颅高压症状，以及抽搐、发热和精神异常，但是腰穿脑脊液检查可以鉴别脑炎的类型。病毒性脑炎的脑脊液外观为清亮、透明，细胞数多在0-50个，以淋巴细胞为主，糖、氯化物及蛋白正常。结核性脑炎脑脊液外观呈黄色黏稠状，细胞数多在100-500个，以淋巴细胞为主，糖及氯化物降低而蛋白升高。而化脓性脑炎的脑脊液外观呈白色米汤状，细胞数常超过500个，以中性粒细胞为主，糖和氯化物也降低。