降低抗结核药物对身体的副作用，需要联合适量用药，尽量应用一线药物。抗结核治疗要联合用药，避免产生耐药和复发，且药物要选择一线药物，一线药物的疗效和安全性均优于二性药物，剂量要适合，这样既可以保证疗效，又可以避免造成大剂量的应用，导致副作用的加大。
抗结核治疗最常出现的副作用是胃肠道反应和肝脏的损伤，为了降低胃肠道反应，可以进行饭后服药。胃肠道反应的发生率较高，但是一般副作用不明显。肝脏损伤是比较严重的副作用，为了避免出现严重的肝损伤，可以加用保肝药物来降低肝损伤，防止出现严重的肝损伤导致停药，可以保证完成疗程，规范化治疗完成疗程是抗结核治疗的关键。