食管穿孔的预防主要是避免危险因素，注意及时对原发疾病治疗，避免患者腹内压升高。加强教育、养成良好的进食习惯，家长注意看护儿童和老人，避免吞食尖锐物品。本病一般没有早期筛查方式。
（1）注意及时对原发疾病治疗，如头部肿瘤、癫痫、慢性咳嗽、食管炎等。
（2）避免患者腹内压升高，妊娠时注意避免剧烈孕吐，保持大便通畅。
（3）家长注意看护儿童和老人，避免吞食尖锐物品。
（4）吞咽异物后应该及时到医院就诊，切忌吞咽大块食物或食用馒头、饭团强行吞咽。
（5）养成良好进食习惯，进食时应该专心致志，细嚼慢咽，尽量不要喝水。吃鱼与带有骨头的食物时应谨慎，防止咽下骨头碎渣与鱼刺。