消化功能紊乱的治疗包括：
一、因为消化系统功能紊乱，主要是由于精神因素导致的，比如情绪过度紧张、焦虑，工作、生活压力过大，干扰神经系统的正常活动，引起胃肠道的功能障碍，主要的方法就是要改变这种不良的精神状态，尽量保持情绪舒畅，可以适当的应用调理植物神经系统的药物，同时配合心理疏导。
二、平时要注意饮食的调理，清淡饮食，减轻胃肠道的负担，坚持适当的运动，有助于症状的改善。如果症状严重，明显的感到不适，可以对症应用保护胃黏膜促进消化的药物，有助于减轻患者症状。