早期的梅克尔憩室并且无症状的患者可能不需要立即治疗，而高风险的梅克尔憩室患者则可以考虑采用积极的治疗方法，例如手术摘除。
一、药物治疗
1、布洛芬：患者如果出现重度的腹部疼痛，可以服用一些缓解疼痛的药物比如布洛芬等。有一定的抗炎的作用，可以有效缓解梅克尔憩室的症状。
2、抗生素：如头孢他啶、头孢曲松，可杀死致病菌，缓解发热、腹痛等症状。
二、手术治疗
1、憩室切除术：梅克尔憩室切除术是去除小肠和小肠内膜异常憩室的手术。需要通过憩室的长度，基础大小和位置来进行手术。
2、回肠切除端端吻合术：通常是用来针对基底部穿孔和腹腔粘连的患者，也很适合创伤面较小的探查手术方式。