化脓性甲沟炎需要与甲银屑病、湿疹进行鉴别。
1、甲银屑病：与化脓性甲沟炎相比，甲银屑病的甲沟炎症状不明显，患者的甲板有顶针状凹陷，身体的其他部位可有银屑病的皮损而化脓性甲沟炎大多症状仅局限于趾甲周围，一般没有全身症状，也无皮肤脱屑的表现。
2、湿疹：湿疹的皮损是以全身的红斑、丘疹、丘疱疹为主，瘙痒剧烈，与化脓性甲沟炎相比，发病的部位不同，化脓性甲沟炎通常仅局限在趾甲周围，湿疹通常累及全身。有时可累及甲板和甲皲襞，但一般先由手指开始，以后再累及甲板和甲皲襞。