胃肠道间质瘤合并有肝转移，属于胃肠道间质瘤的晚期表现，患者是否能活过5年要看肝转移的情况。如果是单发的肝转移，可以进行肝转移灶手术切除或者是射频消融治疗，配合术后的靶向治疗，患者可以生存5年。患有胃肠道间质瘤的患者由于目前有靶向药物可以使用，一代有伊马替尼，二代的有舒尼替尼，通过这些靶向药物以及配合手术放疗等综合治疗手段，即使是进行肝转移的患者，5年生存率也在30%-40%左右。