做电子结肠镜有点痛苦，但是正常人都可以忍受。目前做电子结肠镜有普通和无痛两种，普通的相对来说会痛苦一点，无痛的检查没有感觉，也就是睡一觉肠镜就做完了。
做电子肠镜准备的过程，相对来说会痛苦一点，因为需要喝大量的泻剂来排出肠道内的大便，也就是清洁肠道，一般需要排便5-6次，才可以把肠道内的大便排出来，清洁的越干净越好。在清洁肠道的过程中，有的患者会出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等情况，这些是正常的反应，建议坚持服用，必要的时候可以加用对症的药物。