无虹膜目前尚无明确治疗策略，临床上的治疗主要以对症治疗及相应并发症的治疗为主，且需要终身治疗。
一、一般治疗
出现畏光、眯眼睛等症状的患者，可以考虑配戴有色眼镜或角膜接触镜。除此之外，早期配戴有色角膜接触镜还可达到减轻眼球震颤的作用。
二、药物治疗
对于伴随有青光眼的患者可以首先用药物控制眼压，比如β受体阻滞药(阿替洛尔、美托洛尔)、碳酸酐酶抑制药(乙酰唑胺)，若药物控制不理想，可考虑手术治疗。
三、手术治疗
1、对于伴随角膜硬化症病变患者，可以早期给予人工泪液以及抗炎药物，延缓病程的发展，随着疾病的发展，绝大多数患者需要进行手术治疗，如角膜移植等。但因为虹膜等眼部结构异常，手术成功率并不高。
2、对于伴随白内障患者，可以考虑予以手术摘除白内障并植入人工晶体，但相比于一般的白内障患者，手术难度更大、风险更高，可能加重青光眼及角膜上皮损伤等。
3、对于伴随有青光眼的儿童患者，建议预防性行前房角切开术、小梁切开术、引流阀植入术等，治疗效果一般较好。
四、其他治疗
无虹膜患者伴随有晶状体异常，尤其是晶状体脱位者将会发生大的屈光不正，因此必须谨慎地使用睫状肌麻痹剂后检查屈光，将所有的屈光不正均予以矫正。