无排卵型功能失调性子宫出血的病因为中枢神经系统下丘脑-垂体-卵巢轴神经内分泌调控异常，或卵巢、子宫内膜或肌层局部调控功能的异常。
一、主要病因
1、青春期黄体功能不足：青春期功血患者血E2水平在育龄妇女的正常范围内，但无正常月经周期中期的血LH、FSH峰，提示主要病因是下丘脑-垂体对雌激素的正反馈反应异常。如果此时受到过度劳累、应激等刺激，或肥胖、胰岛素抵抗等遗传因素的影响，就可能引起功血或其他月经病，如多囊卵巢综合征。
2、围绝经期黄体功能不足：此时妇女卵泡储备低，对促性腺激素的敏感性也降低，或下丘脑-垂体对性激素正反馈调节的反应性降低，因而可先出现黄体功能不足，间断或不规则排卵，最终排卵停止。此时卵泡仍有一定程度的发育，但缓慢、不充分，或退化不规则，不足以引起正反馈，造成孕激素水平不足或缺如而引起本病。
3、育龄期内分泌失调：可因内、外环境内某种刺激，如劳累、应激、流产、手术或疾病等引起短暂的无排卵，亦可因肥胖、多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等长期存在的因素引起持续无排卵。
二、诱发因素
1、劳累、应激、流产、手术：物理性刺激导致内分泌功能紊乱，从而导致无排卵型功能失调性子宫出血。
2、肥胖：易出现多囊卵巢综合征，从而导致无排卵型功能失调性子宫出血。
3、多囊卵巢综合征：多囊卵巢综合征的患者卵巢滤泡持续时间长，但不能成熟而达到排卵，使子宫内膜处于持续的雌激素刺激之下，缺乏孕酮的调节和周期性内膜脱落，导致内膜发生增生改变。