骨折40天仍然低烧，从理论上讲不正常。一般情况下，骨折一周内发生低烧属于正常现象，超过一周就不太正常，这时候应该要高度怀疑存在一定的感染迹象。此时应该拍X光片，检查骨折局部情况，有没有吸收好，同时检测一些感染指标，包括血常规、C反应蛋白、血沉、降钙素原，根据检查的结果来决定下一步治疗。
通常情况下，这种低烧代表一定的低毒性感染，如果细菌的毒力比较高，则会出现体温高热而不是出现低烧。可以根据经验，使用一些抗生素进行对症治疗，观察有没有效果，最常用口服的是头孢类抗生素，可以口服一周左右，看一下效果。当然也可以到医院，在骨折断端进行局部穿刺，将抽出液进行细菌培养，根据培养的结果进行相关的治疗。但是有时候低毒性感染，可能培养结果不一定是阳性，最好根据经验使用抗生素进行治疗。