支气管纤维镜存在误吸、出血、支气管痉挛、气胸、心脏骤停等风险，因此需要引起注意。
1.误吸：支气管镜检查需局部使用麻药，可能出现胃液反流吸入气管导致肺部感染。
2.出血：操作过程中局部活检及治疗的损伤会引起出血，可局部止血，若出血量较多可给予止血药物。
3.支气管痉挛：支气管镜刺激可能发生广泛支气管痉挛，均宜用氨茶碱预防治疗。
4.气胸：周围性肺癌行纤支镜检活检，伤及脏层胸膜可能出现气胸。
5.心脏骤停：原有心脏病，如冠心病、高血压心脏病等，在纤维支气管镜检查中血氧降低，可能出现心律失常或心脏骤停。