阿莫西林和头孢属于同一类抗生素，即β内酰胺类抗生素，其抗菌普和疗效类似，主要针对细菌感染，不具有直接的可比性。对于扁桃体炎的治疗都可以使用，但是最好先使用阿莫西林，因为如果阿莫西林效果不好，可以更改为头孢，若是先用头孢效果不好，原则上不能更改为阿莫西林。而且阿莫西林对肾脏的副作用小，如果患者有肾炎等肾脏疾病，那就更应该选择阿莫西林。