在目前临床上，尚没有直接针对胆管细胞癌组织病理学的靶向治疗药物。目前在使用的靶向药物，都是一些具有非特异性靶向作用的药物，由于胆管细胞癌也是原发性肝癌中一种特殊的细胞学类型，因此，在临床上也可以借鉴肝细胞肝癌使用的靶向药物，用于胆管细胞癌的治疗，主要包括索拉非尼、舒尼替尼等。此外，临床上也有使用其他泛靶点的抗肿瘤血管抑制剂，如可使用血管内皮抑制素、贝伐珠单抗等进行治疗。