急性化脓性甲状腺炎是一种内分泌急症，严重者甚至危及生命，因此需要早期诊断及治疗，一般短期治疗即可控制病情，可采取药物治疗、穿刺抽脓引流治疗、手术治疗等手段。
一、一般治疗
患者发病后应注意休息，增加热量摄入，加强营养，若出现发热症状，可冷敷以物理降温。
二、药物治疗
1、抗感染治疗：本病一经确诊多需使用抗生素治疗，应根据甲状腺穿刺液的病原菌培养及药敏试验结果，使用针对性的抗生素。
2、止痛治疗：若患者出现甲状腺部位疼痛明显，应给予非甾体类消炎药改善症状，一般可给予塞来昔布、布洛芬等。
三、手术治疗
1、保守治疗无效者，应尽早给予手术治疗。
2、有脓肿形成者，应及时行颈部脓肿切开引流术或腺叶切除术。
3、明确有梨状窝窦管的患者，应在炎症控制后，行梨状窝窦管切除手术治疗。
四、其他治疗
急性化脓性甲状腺炎患者，若出现局限性的小脓肿，可以在B超引导下穿刺抽脓，并引流排脓，可减少疼痛和发热。