治疗脑积水的方法主要是针对病因进行治疗，比如对于阻塞性脑积水，解除阻塞病因是最理想的方法，常用的手术方法有中脑水管成形术或扩张术、第四脑室正中孔切开或成形术、枕骨大孔先天性畸形者行颅后窝及上颈椎椎板减压术，切除阻塞脑脊液流通的肿瘤、囊肿等。如果是交通性脑积水，治疗方法主要以手术治疗为主，手术的方式可以有脑室-腹腔分流术，是目前最常用的分流手术。其他方式有脑室-心房分流术、侧脑室-小脑延迟分流术。