骨良性纤维组织细胞瘤的病因目前在医学界上尚未明确，可能与成人型非骨化性纤维瘤和巨细胞瘤的退化等因素有关。好发于20~39岁之间的成年人，巨细胞瘤的退化、成熟阶段的成人型非骨化性纤维瘤也会诱发本病。
1、巨细胞瘤的退化：巨细胞瘤病变部位与骨良性纤维组织细胞瘤相似，属于一种常见的骨恶性肿瘤，退化后可能转归于骨良性纤维组织细胞瘤。
2、成熟阶段的成人型非骨化性纤维瘤：非骨化性纤维瘤是由组织成纤维细胞组成的骨骺端错构瘤，常见于儿童以及青少年。本病若发展成为成熟阶段的成人型，则极易引起骨良性纤维组织细胞瘤。