肠息肉主要是手术治疗，由于息肉容易癌变，所以主张手术切除。暂不行手术切除者，建议每3~6个月复查肠镜。
一、一般治疗
1、禁食：术前至少空腹8小时，口服泻药排便，清空肠道以免影响视野。
2、对症处理：如有出血，给予止血，并根据出血量多少进行相应处置。
二、药物治疗
1、对症治疗：有便秘口服乳果糖，有腹泻口服益生菌、蒙脱石散。
2、病因治疗：溃疡性结肠炎导致的炎性息肉参见溃疡性结肠炎的治疗，使用柳氮磺吡啶或者免疫抑制剂。
3、预防治疗：家族性腺瘤性息肉病患者可服用塞来昔布减少腺瘤性结直肠息肉数目，每日两次，与食物同服。
三、手术治疗
1、经腹和直肠切除：绝大多数结直肠息肉不需要进行开腹手术，在结肠镜下就可以切除。如果患者的息肉为罕见的遗传性综合征，如家族腺瘤性息肉病，需要开腹进行手术切除结肠和直肠。
2、内镜下黏膜切除术：该手术是一种在结肠镜下对无蒂的、平坦的息肉或早期癌症进行切除的新技术。它通过往黏膜下层注射液体(甘油果糖+肾上腺素+亚甲蓝)，将息肉抬起，然后用圈套器将息肉完整圈除。
3、黏膜剥离术：对于直径大于2cm且需一次性切除病变、抬举征阴性的腺瘤及部分早癌、内镜下黏膜切除术残留或复发治疗困难者，可以实行黏膜剥离术治疗。黏膜剥离术是一种新型的治疗结直肠巨大息肉的方法，它通过在病变下方的黏膜下层注射液体(甘油果糖+肾上腺素+亚甲蓝)，将病变抬高，然后用IT刀或Flex刀在病变的周围和底部逐渐切割，最后将病变完整切除。
4、高频电切除术：可选择内镜下高频电切除术，对消化道的息肉进行摘除。
四、中医治疗
中医对于大肠息肉症状的治疗有明显的效果，在中医里，可分为肠道湿热、湿瘀阻滞、气滞血瘀、脾虚夹瘀四种症候类型，可予行气化湿、活血止痛、清热利湿、等药物，但中医治疗需遵循辨证论治的原则，因人而异，需找专业医师指导治疗。