轮状病毒性肠炎可并发呼吸系统并发症、神经系统并发症、消化系统并发症以及循环系统并发症，具体如下：
1、呼吸系统并发症：可出现上呼吸道感染、喉炎、支气管炎、肺炎等症状。
2、神经系统并发症：可表现为抽搐，无热惊厥，一般发生在病程的1-3天，多呈全身强直-痉挛性发作，多数5分钟内缓解，亦可引起病毒性脑炎。
3、消化系统并发症：可发生肠套叠；新生儿感染可导致坏死性小肠结肠炎；可引起继发性碳水化合物或乳糖不耐受，导致肝损害，表现为转氨酶升高；部分病例可发展为迁延性或慢性腹泻，导致营养不良等。
4、循环系统并发症：轻症者表现为心肌损害，重症者表现为心肌炎，出现心律失常、房室传导阻滞等，可导致死亡。