1、体格检查：可通过体格检查以及测量体温等看患儿是否有发热，脑膜刺激征是否为阳性，囟门是否饱满或者突出，了解患者精神状态以及反应能力。
2、神经影像学检查：头颅磁共振检查较头颅CT检查更能清晰地反映脑实质病变，在病程中重复检査能发现并发症并指导后续治疗及观察疗效。
3、脑脊液检查：是确诊本病的重要依据，脑脊液压力增高，外观混浊似米汤样，白细胞总数显著增多，大多超过1000X10^6/L，脑脊液糖减低、蛋白增高。
4、外周血象：白细胞总数大多明显增高，以中性粒细胞为主。但在感染严重者，有可能出现白细胞总数减少。
5、颅脑影像学检查：颅脑MRI对多房性及多发性小脓肿诊断价值较大，MRI具有良好的组织分辨率，对灰、白质的分辨异常清晰，以及无创性、无辐射的优点。
6、血清降钙素原（PCT）：可能是鉴别无菌性脑膜炎和细菌性脑膜炎的特异和敏感的指标之一，血清PCT>0.5ng/ml提示细菌感染。