在临床上免疫缺陷病和自身免疫病是两种完全不同的疾病。免疫缺陷病是指先天性的免疫系统发育不全，或者因为某些特定原发疾病导致的免疫系统受到伤害引起的一类疾病，免疫缺陷病的患者往往容易发生细菌病毒等致病菌的感染，肿瘤的发生率比较高。自身免疫病是指身体的免疫系统对自身正常的组织细胞发生免疫反应造成的一类疾病，两种病的发病机理和治疗都不相同。