右侧输尿管结石和不典型急性阑尾的区别，可通过以下几个方面加以鉴别诊断：
一、病史，急性阑尾炎的病史会有典型的转移性右下腹痛，即疼痛开始时位于上腹部，随着时间的进展逐渐转移至并固定于右下腹。而输尿管结石，一般疼痛开始于右侧的腹部和腰部。
二、疼痛的性质，急性阑尾炎开始疼痛时一般疼痛性质较轻，随着时间的进展会逐渐加重。而输尿管结石的疼痛开始时即较为严重，但中间有间歇期。
三、辅助检查可通过右下腹阑尾彩超或CT，以及泌尿系的彩超或泌尿系平片加以鉴别诊断。另外，输尿管结石一般尿常规会有白细胞，及红细胞明显的升高及血尿，而急性阑尾炎血常规会有明显升高，以及白细胞、中性粒细胞会有相应的升高。